Solution Systems Inc.

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Huygens

Scientific Volume Imaging b.v.

Scientific Volume Imaging社は1994年にデコンボリューション処理ソフト専門会社としてオランダ（アムステルダム）に設立されました。クロスプラットホーム（Mac OS-X, Windows, Linux）で実行可能で、さまざまな光学顕微鏡を使って取得する生物系画像データに生ずる光学ボケ取り(反射及び周辺ボケを除く)及びZ方向解像度を数学的手法で改善するソフトウエアです。

商品群はデコンボリューション処理、解析、ビジュアライゼーションなど光学顕微鏡を使った画像取得データ研究用の解釈にさまざまな機能を提供しています。
市販のプラットフォームで実行可能でnVIDIAのGPUの使用で高速処理が可能です。
Huygensは、北海道大学ニコンイメージングセンターにて稼働中。

◆アプリケーション◆

サンプル画像はメーカのリンク先でご覧ください。

■ Cell Biology

■ NeuroScienses

■ Genetics and Developmental Biology

■ Immunology

■ Plant Biology

■ Virology/Microbiology

メーカの日本語ホームページでは主要な情報が日本語で説明されています。
下記リンク中の xxxx/J は日本語ページにリンクされています。

■特徴

• Maximum Likelihood Estimation(MLE)アルゴリズムの採用
• クロスプラットフォーム（Mac OS-X, Windows, Linux, Unix）のスタンドアロン
• 豊富な画像処理モジュールに対応（Confocal,Widefield,Nipkow Disk,Muti-Photon,STED,LightSheet,ArrayDetector）に対応
• 2次元、3次元チャンネル、タイムラプスに対応
• 手順に従ってパラメータを入力する簡単操作(Essential)
• PSF distillerでビーズ測定からPSFを作成
• ファイルサポート標準（ICS, TIFF, OME 他）
• 拡張ファイルサポートオプション（Abberior,Zeiss,Leica,Olympus,Metamorph,Nikon,BioVision 他）
• マルチ、タイムラップス表示機能(標準）（Twin Slicer ）
• ボリュームレンダリング表示機能（標準）（Simulated Fluorescence Process/J）

■ベイシック製品の種類

Huygens Essential/J	インタラクティブ操作でデコンボリューション （一般生物研究者向け）
Huygens Professional/J	デコンアルゴリズムの選択及び画像演算、操作、表示、解析などがサポートされ、スクリプトで処理がカスタマイズできる上級者向けバージン（生物物理学研究者向け）
Huygens Core/J	マルチユーザの使用が可能でリモートでHuygensを操作できる
Huygens Localizer/J	高分解能画像(STORM/PALM)用 2D&3Dローカライザー

■使用方法の種類

Node-locked	実行するPC1台にロックして使用する
Everywhere Subscription	複数台のPCからログインで期限使用が可能
Floating Everywhere	マルチユーザの使用が可能でリモートでHuygensを操作できる

■アルゴリズムの種類

Classic Maximum Likelihood Estimation(CMLE):

＊最も一般的な３Dデコンボリューション

Goods Roughness Maximum Likelihood Estimation(QMLE):

＊STEDのようなノイズの多いデータ用

Quick Maximum Likelihood Estimation(QMLE) :

＊蛍光画像のような低ノイズデータ用

オプション（処理サンプル画像は各リンク先でご確認ください）

■デコンボリューション処理モジュール

明視野/J,　蛍光/J,　Nipkow/J,　レーザ共焦点/J,　多光子,STED/J,
Light Sheet/J,　Array Detector/Jに対応

■解析モジュール

• Object Analyzer：３Dデータのオブジェクトをインターラクティブ又は自動で測定
• Object Tracker：３Dデータのオブジェクトをインターラクティブ又は自動で追跡
• Colocalization Analyzer：蛍光標識のオーバーラップの解析

■ビジュアライゼーション

• MIP Render : MIP処理での表示
• MovieMaker：プレゼン用複雑なムービー作成
• Surface Rendering：ポリゴンサーフェイスでの３D表示

■復元モジュール

• Chromatic Aberration Corrector : 多色画像の色ずれ補正(X,Y,Z)
• Crosstalk Corrector : チャンネル間のクロストーク補正
• Object Stabilizer : タイムラプス撮りこみ時の対象物の位置補正
• PSF Distiller/J：PSFの測定モジュール
• Tile Stitching : 複数画像の貼り付け

■その他の機能

• Full File Reader : 各顕微鏡メーカのRAWファイルの読み込み
• Deconvolution Express : 簡易操作でデコンボリューションを実行
• GPU support/J : 高機能GPUボードのサポート
• Batch Feeder : 指定されたフォルダー内画像を自動的にデコン処理実行

サンプル画像

下記画像はScientific Volume Imaging社のHuygensソフトウエアで作成されたものです。画像の版権は拡大画像の下段に表示されます。オリジナル画像は（https://svi.nl/homepage）で確認できます。

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• Huygensは、北海道大学ニコンイメージングセンターにて稼働中。
• （より多くの処理画像が掲載されています。）
• メーカサイトのImage Gallery, Movie Galleryでも様々なデコンボリューション処理例が見られます。

＝＝＝↓画像の上にカーソルをのせると処理後の画像が現れます。↓＝＝＝

※ユーザデータを処理できるデモソフトを用意しております。
必要な方は当社salesまで。